Häufig wölben sich Ganglien unter der Haut hervor. Dann sind sie als kugelförmige, gummiartige aber manchmal auch feste Strukturen sicht- und tastbar. Wenn sich ein Ganglion nicht in der Nähe der Haut ausbildet zur Haut hin verlagert, wird es oft erst entdeckt, wenn Beschwerden auftreten. Auch Zufallsbefunde sind sehr häufig.
Die meisten Ganglien lösen keine Beschwerden aus. Häufig werden sie jedoch als unästhetisch wahrgenommen. Viele Betroffene kontaktieren zudem eine Ärztin/einen Arzt, da sie befürchten, dass es sich bei der Veränderung um einen bösartigen Tumor handeln könnte.
In manchen Fällen können Ganglien unangenehm sein oder Schmeren verursachen. Selten schränken sie die Beweglichkeit von Gelenken ein oder führen durch Druck auf Nerven zu Gefühlsstörungen, Nervenschmerzen und/oder Lähmungserscheinungen.
Bei Mukoidzysten in der Nähe des Nagelbetts kann die Nagelbildung gestört sein. Häufig ist der betroffene Nagel gerillt, auch Wunden im Bereich des Nagelbetts können entstehen.